LAMMPS en las GPUs Tesla

LAMMPS es un paquete de dinámica molecular clásico escrito para ejecutarse con más eficiencia en máquinas paralelas. La versión CUDA de LAMMPS se acelera trasladando el cálculo de fuerzas a la GPU.

Descarga e instalación

• LAMMPS para GPU
• El código de LAMMPS para GPU está preparado para MPI y mejora su rendimiento a medida que crece el clusters de GPUs en el que se ejecuta.

Datos de rendimiento

Como se observa en el gráfico, LAMMPS mejora visiblemente su rendimiento a medida que aumenta el número de GPUs. Dos GPUs Tesla superan el rendimiento de 24 CPUs al ejecutar LAMMPS.

Datos cedidos por cortesía de Scott Hampton y Pratul K. Agarwal, Oak Ridge National Laboratory

Artículos técnicos y presentaciones

• From SC09: Harnessing GPU Speed to Accelerate LAMMPS Particle Simulation - Paul Crozier, Sandia National Laboratory
• Aceleración de aplicaciones de dinámica molecular utilizando la GPU
• Aceleración de aplicaciones de química cuántica utilizando la GPU

Foros de discusión

• Comunidades de GPU computing en GPUcomputing.net

Las aplicaciones de Tesla Bio Workbench pueden implantarse en superordenadores personales de sobremesa o en centros de procesamiento de datos (CPD). Son soluciones basadas en la arquitectura de cálculo paralelo masivo CUDA y han sido diseñadas para acelerar el avance de las ciencias computacionales.

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