Cientistas envolvidos na descoberta de drogas registam um aumento até 100 vezes no desempenho da computação

SANTA CLARA, CALIFÓRNIA — 29 de Abril de 2010 — A investigação científica demorada relacionada com a descoberta de drogas pode agora ser acelerada com o lançamento do AMBER 11, um software que permite rentabilizar a potência da supercomputação nos computadores de secretária dos biocientistas.

O AMBER 11, a mais recente versão de uma das aplicações mais utilizadas pelos bioquímicos e outros envolvidos na investigação da dinâmica molecular, está optimizado para ser executado nas unidades de processamento gráfico (GPUs) da NVIDIA®, que acelera a ferramenta até 100 vezes em relação a um servidor tradicional baseado em CPU. As GPUs fornecem o desempenho de uma estação de trabalho de secretária que só podia ser alcançado anteriormente num supercomputador, melhorando a produtividade porque os cientistas já não precisam de esperar por tempo num supercomputador partilhado ou num cluster departamental de servidores.

“O recurso da supercomputação utilizado está constantemente superlotado, forçando-nos a esperar um dia ou mais para executar uma simulação, adicionando semanas aos nossos projectos de investigação” disse Ross Walker, professor de investigação no Centro de Supercomputadores de São Diego, na Universidade da Califórnia, São Diego, e um dos principais colaboradores do AMBER.

O AMBER 11 foi concebido para aproveitar as vantagens das GPUs NVIDIA Tesla™ 20, que utilizam a arquitectura CUDA™ paralela para as necessidades específicas das aplicações de computação de elevado desempenho. Nos primeiros testes com a comunidade de utilizadores do AMBER, o professor Ross Walker recebeu mais de uma dúzia de relatórios com aumentos de velocidade superiores a 30 vezes num conjunto de simulações biomoleculares.


“Com as GPUs, podemos agora fazer a maior parte do nosso trabalho na secretária e isso muda tudo. Qualquer departamento de investigação que pretenda investir em recursos de computação para executar o AMBER deve começar por equipar todos os investigadores com estações de trabalho com GPUs” acrescentou Walker.

O professor Ross Walker verificou que apenas uma GPU Tesla fornece a mesma potência de processamento que um cluster de elevado desempenho de 512 núcleos de CPU durante a simulação de um nanosegundo na vida de um nucleossoma de solvente implícito de 25.000 átomos. Numa simulação de um solvente explícito mais simples, como, por exemplo, o benchmark JAC, verificou que uma GPU Tesla fornece uma potência de processamento equivalente a 48 núcleos do supercomputador NSF Ranger.

“Aumentos de desempenho desta magnitude permitem nova ciência e o trabalho efectuado com o professor Ross Walker é um destes progressos” disse Andrew Cresci, director-geral de marketing vertical da NVIDIA. “Com o AMBER 11, os cientistas podem agora testar muitas mais teorias e simular muitos cenários diferentes devido à velocidade permitida pelas GPUs e mais importante, a facilidade de acesso a estações de trabalho com GPUs”.

Para mais informações sobre o AMBER 11, vá aqui. Para mais informações sobre a Tesla Bio Workbench da NVIDIA, iniciativa da NVIDIA, da qual o AMBER é um componente, para permitir aos biofísicos e químicos computacionais romper os limites da investigação bioquímica através da utilização de GPUs, vá aqui.

Acerca da NVIDIA
A NVIDIA (Nasdaq: NVDA) despertou o mundo para a potência dos gráficos de computador quando inventou a GPU em 1999.  Desde então, definiu consistentemente novas normas na computação visual com gráficos interactivos e espantosos disponíveis em dispositivos desde os leitores multimédia portáteis aos computadores portáteis e estações de trabalho. Os conhecimentos da NVIDIA em GPUs programáveis conduziram a avanços no processamento paralelo que tornaram a supercomputação económica e muito acessível. A empresa tem mais de 1.100 patentes norte-americanas, incluindo patentes que abrangem designs e conhecimentos fundamentais para a computação moderna. Para mais informações, visite www.nvidia.es.

Determinadas declarações deste comunicado de imprensa incluindo, mas não se limitando a, declarações sobre: GPU NVIDIA Tesla, arquitectura CUDA e Amber 11 são declarações viradas para o futuro que estão sujeitas a riscos e incertezas que podem originar em resultados diferentes das expectativas. Os factores importantes que podem provocar variações materiais nos resultados actuais incluem: desenvolvimento de tecnologia mais rápida e eficiente; defeitos de design, fabrico ou software; impacto do desenvolvimento tecnológico e dos concorrentes; alterações nas exigências e preferências dos utilizadores finais; alterações nas normas e interfaces da indústria; perda de desempenho imprevista dos nossos produtos ou tecnologias quando integradas em sistemas; outros factores detalhados de vez em quando nos relatórios da NVIDIA para a Securities and Exchange Commission (SEC), incluindo o Formulário 10-K para o período fiscal terminado em 31.01.10. As cópias dos relatórios enviadas para a SEC são publicadas no nosso sítio Web e estão disponíveis através da NVIDIA gratuitamente. Estas declarações viradas para o futuro não são garantias de desempenho futuro e só se referem à data acima indicada, e, excepto conforme requerido por lei, a NVIDIA renuncia a qualquer obrigação para actualizar estas declarações viradas para o futuro para reflectir futuros eventos ou circunstâncias.

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